Hello,
En préambule:
Il ne faut pas passer par l’updater interne (qui est désactivé dans l’application dorénavant). Cela casse l’intégration LDAP.
La nouvelle version 0.6.7 est en cours de test et va être livrée incessament sous peu:
Ceci dit, lors de la mise à jour du serveur, celui-ci peut mettre un bon moment (de l’ordre de 30sec sur mon raspberry 3) à redémarrer.
Donc première étape : re-essaye 
si cela ne fonctionne toujours pas, peux tu envoyer :
- le contenu de
/var/log/calibreweb/calibreweb.log - le retour de la commande
sudo systemctl status calibreweb.service