Salut Corwynn,
Pas de solution à t’offrir mais un peu de compassion et de retour d’expérience 
J’ai installé La Brique sur une LIME2 la semaine passée (Topic : Serveur local Yunohost sur Raspberry-pi - contexte de faible connectivite internet) après quelques difficultés (apt-get dist-upgrade bloquait sur la mise-à-jour du client MySQL, finalement quelqu’un de Neutrinet m’a très gentiment fourni une image à jour que j’ai encore sous la main si tu veux).
Même problème que toi pour le flux security.rss.
Concernant l’installation des applications : l’install d’OwnCloud m’a pris presque 20min (contre moins de 2min pour un VPS Gandi) mais ça a marché sans timeout, au bout de combien de temps ton timeout est apparu ? peut être qu’il faut que tu trouves où ce temps est défini et l’augmenter.
As-tu essayé d’installer une autre app légère (OpenVPN doit pas être lourd), par exemple Zerobin, pour voir si ça passe ?
Bon courage,