Pour que nextcloud voit un fichier ajouté dans data/ en dehors des actions du logiciel nextcloud lui même, il faut lancer un scan avec la commande fournie par le projet nextcloud
Sinon, mettre les sauvegardes dans nextcloud pourquoi pas, mais attention, si nextcloud est lui même sauvegardée, ça veut dire qu’on va sauvegarder des sauvegardes de sauvegarde… C’est exponentiel, donc à un moment il n’y aura plus de place.
Enfin, je te suggère de regarder ces 2 tutos qui permettent de mettre en place un backup dédupliqué.