Salut,
ben perso je ne sais pas trop quoi te répondre, mais a mon avis tu te prends un peu trop la tête niveau sécurité 
Exposer un searx publiquement n’est pas plus ou moins risqué qu’exposer un blog ou autre … Je doutes que tous les hackers / bots de la planète se jettent d’un seul coup sur ton serveur parce qu’ils ont vu un searx apparaître, ils ont d’autres choses à faire et des cibles plus intéressantes à viser …
Si tu veux une discussion un peu plus large sur la sécurité d’un serveur yunohost, tu peux lire par exemple ce thread (en anglais…) How to secure guide for noob